В игре присутствует 14 могущественных держав, но играбельных всего 8. Все военные действия происходят на различных локациях, они были скопированы с территорий, на которых происходили реальные боевые действия. Пользователю дают возможность пройти всю сюжетную кампанию, поделенную на главы. В каждой из них, предусматривается набор основных и побочных заданий, они будут появляться по мере прохождения сюжетной линии.
Геймплей игры основан на добыче ресурсов, позволяющих повышать экономическую составляющую войска. Для улучшения боевой мощи, необходимо производить сбор различных природных ресурсов, благодаря ним создавать предметы, которые можно реализовать для продажи. Все собранные деньги, необходимо вкладывать на развитие армии – покупку снаряжения, провианта.
Пользователю предстоит возводить различные сооружения, для обороны своих жилых построек. На протяжении всего прохождения, игрок должен полностью контролировать все процессы, производимые своей армией. Дипломатия, стала одной из важных составляющих, теперь можно не просто отправлять свою боевую мощь на массовую погибель, а добиться урегулирования конфликта мирными переговорами.
Игровая механика получила значительное обновление.
В Age of Empires 3 появились корабельные баталии. Стратегическое планирование боевых действий на морском судне, играет важную роль в освоении морских территорий. Графически игра стала более реалистичной, локации стали более прорисованными и детализированными. Спецэффекты теперь насыщенные и красочные. Музыкальная дорожка пополнилась саундтреками, специально для корабельных сражений. Звуки моря и всплеск воды, прекрасно вписывается в происходящую картину.